在净化车间工程中，关键部位主要有以下七个环节，必须引起净化工程设计、施工、监督、使用等各方的高度重视。
一、电话和火灾警报：
在洁净厂房内设置电话、对讲电话，可减少清洁区域人员走动，减少发尘量，也可在发生火灾时及时与外界联络，也为正常的工作联络创造条件。另外，还应设置火灾报警系统，防止火情不容易被外界发现而造成重大经济损失。
二、风管要求经济和效率并重：
对于空调系统和净化系统，风管的要求是既经济又有效。前一种要求价格低，施工方便，运行成本低，内表面光滑阻力小。二元指的是密封性好、不漏气、不发尘、不积尘、不污染、耐火、腐蚀、潮湿。
三、空调净化应注重节能：
空调净化是能源消耗大户，节能措施的设计和施工值得重视。设计时，系统和区域的划分，送风量的计算，温度和相对湿度的确定，洁净等级和换气次数的确定，新风比，风管保温，风管制造时的咬口形式对漏风率的影响，干管支管连接角度对气流阻力的影响，法兰连接是否漏风等空调箱、风机、冷水机组等设备选择无与能耗有关，因此，这些细节必须考虑周全。
四、根据天气情况选择空调机箱：
对于空调机箱的选择，要考虑其气候条件。冬季气温低、空气含尘量大的北方地区，一般空调机组应增加新的风段，并采用淋水式空气处理，使其既洗气又进行热温交换，以达到所要求的温湿度。而且在气候潮湿、空气含尘量较低的南方地区，则冬季也不必预热新风，对空气的过滤及温、湿度调节采用初效过滤，表冷面调节温湿度，也可加强温减湿工序，再经中效过滤和终端过滤。空调机箱内风使用变频风机，这样不仅节能，还可以灵活调整风量风压。
五、空调机房宜位于洁净室侧面：
空调机机房的位置，宜在洁净室的侧面，这样不仅能节约能源，而且有利于风道的布置，使气流组织更合理，同时可节约工程费用。
六、多机冷水机组更加灵活：
冷水机如要求制冷量大，则不宜选择单台机组，宜采用多机冷，电机宜采用变频调速，以降低启动功率。多种机型可灵活使用，避免出现“大马拉小车”的浪费能源现象。
七、自动控制装置保证全程调节：
当前，一些生产企业采用手动方式来控制风量和风压，但由于风压控制都在技术隔层内，吊顶也都是彩板的软吊顶，所以吊顶也是彩板的软吊顶，基本上都是在安装调试时调好，以后就没再调节了。为了保证洁净厂房的正常生产和工作，应设置一套较完整的自动控制装置，以实现以下功能：洁净室空气洁净度、温湿度、压差监控、风阀调节;高纯气体、纯水和循环冷却水的温度、压力、流量的检测、气体纯度、纯水水质监测等。